El aislamiento de compuestos obtenidos por varios métodos sintéticos se lleva a cabo mediante una amplia variedad de métodos de purificación. Dado que el proceso de purificación ocupa más de la mitad del proceso de producción, la determinación del método de purificación es extremadamente importante. La cromatografía en columna con gel de sílice es uno de los métodos de purificación más útiles para obtener un producto objetivo con alta pureza. También existen otros métodos, como los depuradores, que utilizan la química huésped-huésped para los métodos de purificación. La ciclodextrina es un compuesto utilizado en el método de purificación por adsorción. La ciclodextrina elimina la materia orgánica del agua mediante la inclusión de un compuesto hidrofóbico en ella.